分享一篇发表在JACS上的文章：μMap-Interface: Temporal Photoproximity Labeling Identifies F11R as a Functional Member of the Transient Phagocytic Surfaceome，通讯作者是普林斯顿大学的David W. C. MacMillan教授，该课题组的研究方向是新颖有机催化机制的发现与应用，以及利用光催化技术研究复杂生物环境。
在机体响应病原体或伤口愈合的情况下，通常会有专门的吞噬细胞执行吞噬作用，吞噬作用失调是许多疾病的基础。吞噬作用有四个关键步骤：(1)检测目标；(2) 内吞激活；（3）吞噬杯形成；（4）溶酶体与吞噬体融合和降解。参与调节吞噬作用的瞬时表面蛋白鉴定是蛋白质组学领域具有挑战性的问题，加深对这些蛋白的了解有助于人们开发相应的新疗法。目前的蛋白质组学方法很难捕捉到吞噬作用的瞬时相互作用网络，因为大多数方法主要是研究提取的吞噬体或全蛋白质组水平变化。因此，本文作者开发了一种新型光催化邻近标记方法，命名为μMap-Interface，可以用于在时空分辨率阐明参与吞噬作用的蛋白质相互作用网络。
研究细胞FC依赖性吞噬的有效方法是利用IGG功能化的微珠来模拟调理作用（opsonization），这些微珠能以FC受体依赖的方式被巨噬细胞吞噬。于是，作者将课题组此前开发的μMap光邻近标记技术与上述方法联用，将聚苯乙烯微珠与人源IGG偶联，然后把铱催化剂直接偶联IGG，用于后续标记吞噬杯表面蛋白质组。为了精准捕获瞬时吞噬杯蛋白质组，作者通过温度控制，来控制吞噬前、活化和吞噬后的时间节点。
作者利用两种不同的探针（diazirine和phenyl-azide），在吞噬前、活化和吞噬后的时间点的微珠相互作用蛋白进行生物素化标记，然后用SA bead富集标记到的蛋白，通过TMT和LC-MS/MS进行蛋白质组学研究，并试图发现参与吞噬作用的潜在蛋白。
通过分析吞噬作用“活化组”的数据，作者关注到F11R蛋白，它是一种连接粘附分子，在细胞间接触的粘附调节中起作用，是肺癌、胃癌和胶质母细胞瘤的靶点。接着作者试图研究F11R是否参与巨噬细胞的吞噬作用，他们在THP-1细胞中敲低了F11R，发现吞噬作用增强了。最后，作者还把该方法拓展到其它吞噬细胞类型，有助于人们增加对吞噬过程的认识。
综上，本文作者将μMap技术应用到细胞吞噬作用中，开发了μMap-Interface方法，并发现了参与吞噬作用的新成员F11R。
原文链接：https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jacs.4c11058
文章引用：10.1021/jacs.4c11058
