分享一篇发表在Chem. Sci.上的文章,题目为“A General Approach for Activity-based Protein Profiling of Oxidoreductases with Redox-differentiated Diarylhalonium Warheads”,通讯作者是来自奥地利格拉茨技术大学的Rolf Breinbauer和格拉茨医科大学的Ruth Birner-Gruenberger两位教授,他们的研究方向聚焦于化学生物学、天然产物合成和组学技术。这篇文章中,作者开发了基于二芳基卤鎓的ABPP探针用于标记氧化还原酶。

基于活性的蛋白质组分析(ABPP)是一种重要的化学蛋白质组学工具,其目前主要应用于针对具有亲核残基的蛋白进行分析。然而其他具有复杂催化活性的酶类别如氧化还原酶,仍然缺乏关注。此前已经有一些研究设计针对氧化还原酶的ABPP探针,这些探针的弹头被目标蛋白质氧化激活并转化为亲电试剂,被附近的亲核基团进攻形成共价标记。这篇文章中,作者开发了一类基于二芳基卤鎓还原激活的氧化还原酶ABPP探针。
作者首先设计并合成了多种带有不同二芳基卤鎓反应基团和不同长度linker的探针,并通过循环伏安法和NMR证明,这些探针可以在氧化还原酶的单电子还原下形成芳基自由基中间体。

接着,作者利用重组表达的胆碱氧化酶、丁香酚氧化酶、乳酸脱氢酶等具有不同辅因子的氧化还原酶进行体外探针标记和胶内荧光分析,证明探针可以基于氧化还原酶活性进行共价标记。

随后作者使用这些ABPP探针进行了蛋白质组富集和质谱鉴定,其中3个探针具有较好的表现,分别可以显著标记24、19和22中蛋白质,其中包含多种已经被注释为氧化还原酶的蛋白质。作者进一步确定了探针的标记位点包含所有氨基酸侧链类型,证明探针的标记基于自由基机制。

总之,这篇文章中作者设计了一类基于二芳基卤鎓的探针,用于氧化还原酶的基于活性的蛋白质组分析。
本文作者:LCX
责任编辑:LZ
DOI:10.1039/D4SC08454C
原文链接:https://doi.org/10.1039/D4SC08454C