第一作者: Min Yang
通讯作者: 许文涛, 朱龙佼
通讯单位: 中国农业大学
研究内容:
CircRNA是一组环状的、封闭的、单链的非编码RNA,是癌症诊断和预后的重要的生物标志物。对环状RNA的敏感性和选择性检测可以大大促进人类疾病早期诊断的发展。作者提出了一种基于双催化发夹自组装 (CHA)和变色龙DNA模板银纳米团簇 (DNA-Ag NCs)的无标记比的等温扩增系统CircRNA的度量检测。结果表明,上游的CHA1可以被分析物特异性触发形成双链DNA (dsDNA),发夹DNA-Ag NCs的红色荧光降低破坏发夹结构。通过触发序列,可以进一步激活下游的CHA2,生成另一个dsDNA复合物,从而导致绿色荧光的急剧增加。因此,通过测量绿色和红色荧光强度的比值的明显变化,比值系统可以灵敏地检测和视觉区分环状体核糖核酸。此外,在CHA周期中的两阶段信号扩增使该检测方法具有超高灵敏度的检测性能,其中对RNA靶标的检测限为1pM。此外,该新方法可作为分析不同类型的环状RNA的通用策略,从而显示出其在检测丰富的生物标志物方面的巨大潜力。
示意图1
要点一:
成功构建了基于CHA调制的放大传感器系统,用于Circ-MAT2B的比值检测。该系统已显示成功地实现了同步信号的产生、放大和切换,提高了反应效率。
要点二:
该方法所涉及的CHA9反应发挥了三个重要作用:第一,双CHA反应实现了荧光信号的双重放大;第二,自组装核酸诱导的构象变化,导致DNA-Ag NCs的荧光发射发生变化;第三,当两个发夹形成dsDNA时,Ag NCs荧光增强。
图1:(A) DNA-Ag NCs中荧光变化的形成和过程示意图;(B)H1-Ag NCs和(C)H3-Ag NCs的HR-TEM图像;(D)天然PAGE分析结果;(E)(a)H1-Ag NCs、(b) TDNA+H1-Ag NCs+H2、(c)H3-Ag NCs和(d)TDNA+H1-AgN Cs+H2+H3-Ag NCs+H4的荧光光谱;(F-I)在不同浓度的TDNA存在下,系统的二/三维荧光激发发射图。
图2:(A)不同浓度TDNA存在时系统的荧光变化;(B)荧光强度(F560/F610)与TDNA浓度的对数的比值;(C)对目标TDNA分析系统的选择性。
图3:(A)在不同浓度的TRNA存在下,扩展通用检测系统的荧光变化;(B)荧光强度(F560/F610)与TRNA浓度的对数的比值;(C)扩展通用系统分析目标TRNA的选择性。
图4:(A)检测不同数量的HepG2细胞总RNA中的Circ-MAT2B;(B)检测HepG2和L02细胞裂解液中的Circ-MAT2B的检测。
参考文献
Min Yang, Hongyu Li, Xiangyang Li, Kunlun Huang, Wentao Xu, Longjiao Zhu, Catalytic hairpin self-assembly regulated chameleon silver nanoclusters for the ratiometric detection of CircRNA, Biosensors and Bioelectronics (2022), doi: https://doi.org/10.1016/j.bios.2022.114258.