2015年6月27日，国务院批复同意设立南京江北新区。这是我国第13个、江苏省首个国家级新区。根据《南京江北新区产业发展规划（2015—2030年）》，江北新区未来产业发展定位为“4+2”现代产业体系，重点发展智能制造、生命健康、新材料、高端交通装备等四大先进制造业，以及现代物流、科技服务两大生产性服务业。其中，在生物医药领域以南京生物医药谷为依托，重点集聚生物制药、医疗器械等领域的企业，加快建造千亿级先进生物医药产业集群。

南京生物医药谷地处南京西北部，长江北岸，国家级南京高新技术开发区内，是高新区专业特色子园区。其前身分别历经江苏省“三药”示范基地、江苏省南京新药创业服务中心、江苏省生物医药产业集聚区等阶段。2010年，南京市委、市政府明确了以南京高新区现有的生物医药产业为基础，逐步引导南京市生物医药产业向南京生物医药谷集聚，建设国家生物医药产业基地的发展战略。2011年3月14日，南京生物医药谷发展中心成立；同年3月25日，南京生物医药谷建设发展有限公司成立。

截至2015年底，南京生物医药谷已经聚集生物医药企业276家，涵盖生物制药、化学制药、医疗器械、中医药、研发服务外包等多个门类，代表企业分别有绿叶思科、药石药物、微创医学、海昌中药、金斯康科技等，初步形成了一定的产业规模和集聚态势。2015年，园区实现产业收入200亿元，同比增长42.9%。

南京生物医药谷积极打造现代化产业链，在综合引进医药企业的同时，注重引进和打造高端的医药生物技术研发平台已形成小分子筛选、药效学研究、药理毒理学研究、动物疾病模型、临床数据服务等，逐步形成新药开发各环节上，都有知名企业和研究平台。

2015年底，南京生物医药谷已拥有南京留学人员创业园、人才大厦、江苏省“三药”示范基地、中丹园研发楼一期、中丹园研发楼二期的等专业研发孵化器，以及加速器一期、加速器四期等多个加速器载体。另外，在研发区核心区域，建成企业服务中心、在建会展中心作为商务配套满足企业多方面需求。南京生物医药谷拥有南京高新生物医药公共服务平台、国家遗传基因工程小鼠资源库、药物安全性评价中心等一批药物研发公共技术服务平台，可为药物研发企业提供各类仪器设备、信息、技术等服务，推动产业创新能力提升。

2015年，南京生物医药谷荣获“2014年中国生物医药最具潜力园区TOP10”。

2016年，南京生物医药谷被科技部认定为国家级科技企业孵化器。